Мы ничего не знаем о наличии семьи у помощницы главного программиста. Она вполне может быть одиночкой, безвылазно живущей на базе. Взаимодействие с остальными подразделениями происходит только через шефа. Да он и сам должен был так её сориентировать, когда появились признаки шпионажа. Вообще не вижу проблемы. "Вам кого? Она в отпуске, я за неё. Чем могу помочь?"

Если она живёт в таком режиме, как я предполагаю, с друзьями вне базы общается только по отпускам, на базе только приятели.

С Бернардом кажется понял. Всё было предусмотрено Фордом, он дёргал за ниточки до самого конца.